W latach 1958 – 1960 dokonano generalnej modernizacji starego budynku oddziału chirurgicznego szpitala im. Dłuskiego w Międzychodzie, wówczas również zbudowano tu odrębną kuchnię (dla obu istniejących oddziałów). W 1977 r. przystąpiono do budowy nowego pawilonu szpitala w Międzychodzie, który powstawał etapami w miejsce starego oddziału wewnętrznego. Do 1985 r. zrealizowano dwa etapy tej inwestycji: w pierwszym wybudowano nowy budynek oddziału wewnętrznego, nadbudowano budynek kuchni z przeznaczeniem na oddział dziecięcy oraz dobudowano blok operacyjny do istniejącego budynku chirurgii. W drugim – wybudowano budynek, w którym zlokalizowano oddział reumatologiczny, laboratorium oraz kilka pomieszczeń dla administracji. Trzeci etap, który przewidywał budowę obiektu na potrzeby oddziału ginekologiczno-położniczego, pralni, prosektorium, zaplecza technicznego i pomieszczeń dla centralnej izby przyjęć i pomocy doraźnej, nie wszedł w stan realizacji. W latach 1996-97 udało się jedynie przystąpić do budowy budynku pralni i prosektorium, której z braku środków finansowych nie udało się kontynuować w 1998 r. W latach 1983-87 zmodernizowano budynek Wiejskiego Ośrodka Zdrowia w Łowyniu, natomiast w latach 1994-95 w szpitalu w Sierakowie wyremontowano oddział ginekologiczno-położniczy oraz wybudowano pracownie RTG i USG, jako jednostki ogólnodostępne dla miejscowego społeczeństwa.
W związku z reformą w służbie zdrowia na przełomie 1998 i 1999 r. Zespół Opieki Zdrowotnej w Międzychodzie został przekształcony w Samodzielny Publiczny Zakład Opieki Zdrowotnej funkcjonujący w oparciu o kontrakty z Wielkopolską Regionalną Kasą Chorych, a następnie z Narodowym Funduszem Zdrowia. W wyniku działań restrukturyzacyjnych w 1999 r. została sprywatyzowana Podstawowa Opieka Zdrowotna, z początkiem 2001 r. został uruchomiony Zakład Opiekuńczo-Leczniczy, a z końcem 2002 r. Szpitalny Oddział Ratunkowy, Centralna Izba Przyjęć, Oddział Intensywnej Terapii, przeniesiono Pogotowie Ratunkowe do budynków szpitalnych. W 2003/04r. uruchomiono Oddział Rehabilitacji Kardiologicznej, w 2005r. – Hospicjum Domowe, a z początkiem 2006
r. Ośrodek Rehabilitacji Dziennej (Kardiologicznej). Szpital wzbogacił się o nowoczesny sprzęt diagnostyczno-leczniczy m.in. aparaty RTG, USG, mammograf, respiratory, defibrylatory, aparaty do znieczulenia, a także karetkę „W” oraz „R”.